Le secteur des hydrocarbures constitue le premier employeur formel du pays et la principale source de devises. La production se concentre sur des champs offshore situés au large de Bioko et du Rio Muni, exploités par des compagnies internationales associées à la société nationale. Le pays a rejoint l'Organisation des pays exportateurs de pétrole en 2017. La production, mesurée à environ 93 000 barils par jour en 2021, suit une trajectoire déclinante liée à la maturité des gisements.
Le complexe de Punta Europa, sur l'île de Bioko, réunit une usine de liquéfaction de gaz naturel, une unité de méthanol et des installations de traitement de gaz de pétrole liquéfié. Les autorités promeuvent un modèle dit de méga hub gazier consistant à traiter sur ce site des volumes provenant de gisements voisins, y compris situés dans les eaux d'États riverains, afin de compenser la baisse des ressources nationales.
La zone économique exclusive du pays offre des ressources halieutiques encore peu exploitées à l'échelle industrielle. La pêche artisanale approvisionne les marchés de Bata, de Malabo et des localités côtières. L'économie bleue figure parmi les axes retenus par la stratégie Agenda 2035, avec des projets portant sur les infrastructures portuaires, la chaîne du froid et le contrôle des captures.
Le cacao de Bioko et le café du Rio Muni ont constitué les principales exportations avant l'ère pétrolière et subsistent aujourd'hui à un niveau très réduit. Les cultures vivrières associent manioc, banane plantain, igname et arachide. L'exploitation forestière fournit des grumes et des bois transformés, activité soumise à des règles de gestion durable que les partenaires internationaux suivent avec attention.
Le bâtiment et les travaux publics ont connu une expansion soutenue pendant la période de forte rente pétrolière, avec la construction de routes, d'aéroports, de ports et de la ville nouvelle de Ciudad de la Paz. Le ralentissement des commandes publiques a réduit l'activité du secteur. Les services financiers, le commerce et les télécommunications complètent le tissu économique, la Banque mondiale ayant consacré en 2024 un diagnostic aux conditions de développement de l'économie numérique dans le pays.